如果想要鉴别卵巢囊肿，患者首先可以做B超，能够通过影像观察到卵巢的实性占位或者囊性占位，从而确定是否是卵巢囊肿。在明确了卵巢的囊肿以后，想要进一步的明确具体的性质，可以做腹腔镜取局部病理进行检查，能够确定卵巢囊肿是否存在恶性病变，然后再考虑进一步的手术或者放化疗治疗，建议在月经周期内连续做两次B超以观察生长变化，判断是否属于卵巢囊肿。
一般情况下，卵巢囊肿因囊肿的大小、性状不同，在鉴别诊断上也会存在差异。如患者患有卵巢囊肿，腹内通常存在具有可动性的包块，如患者的卵巢囊肿存在恶性、炎症等情况，可能会有腹部压痛、腹水等症状出现。此时，患者应及时就诊，通过超声检查、腹腔镜检查、放射学诊断等方式明确是否存在卵巢囊肿，并确定其性质。如患者会出现剧烈的下腹疼痛，在排除急性阑尾炎、急性盆腔炎、异位妊娠等疾病后，患者可能存在卵巢囊肿的囊肿蒂扭转的情况，此时可以遵医嘱通过腹部B超检查等方式进行鉴别诊断。确诊后，患者应在医生指导下进行治疗，必要时行卵巢囊肿切除术。
卵巢囊肿鉴别诊断有：B超检测。阴道脱落细胞学图片检查。腹腔镜检查和肿瘤标志物检查。如果出现卵巢囊肿，很有可能会出现一些肿块，而且会有腹部疼痛的感觉，有的人还会出现腹水，必须及时的采用手术的方法才可以治疗，手术过后还需要通过化疗的方法辅助治疗。
卵巢囊肿可能会出现的症状，自觉小腹增大，裤腰紧小。可摸及下腹有块，尤早晨清楚，排尿后又消失。尿频，但无尿痛、尿急；或有便秘，但是随着时间的进展，可以出现腹部进行性增大的肿块，及肿块压迫症状，可以通过B超确诊。
女性体内激素水平紊乱，或者妇科炎症都可能造成卵巢囊肿.
首先需要知道所患的卵巢囊肿是生理性卵巢囊肿，还是病理性卵巢囊肿。生理性卵巢囊肿是由于在排卵期后，由黄体期所形成的囊肿，一般是小于5厘米。在黄体期结束之后，激素水平下降，就会自动消失的，并不需特殊处理。而由于炎症导致，以及内分泌紊乱或者遗传因素所导致，还有子宫内膜异位症所导致的卵巢巧克力囊肿等，就需要根据病情来进行治疗。
