巧克力囊肿要到正规的三甲医院进行诊断，根据不同的病情来制定合理的治疗方案，接受系统、科学的治疗，只有对症治疗才会提高治好的几率，千万不要盲目去治疗，以免加重病情。
巧克力囊肿手术后可以积极选择按摩脐周，以及配合萝卜汤等帮助排气较好，术后避免着凉，平时营养均衡多喝水，放松心情，多补充蛋白质如鸡蛋、鱼等，增强抵抗力，同时可以多吃一些水果和蔬菜，补充维生素。
患有巧克力囊肿后，想要用中药方法治疗，一定要在医生的指导下使用。患者切不可自己用药，中药贴剂治疗、中药汤剂治疗，巧克力囊肿这是一种子宫内膜异位增生的病变，要重视疾病的治疗，中医认为治疗巧克力囊肿首选食疗，饮食上要有足够的营养，不要偏食挑食。不要吃牛、羊、鱼、虾等发物。
巧克力囊肿饮食上，注意营养搭配均衡可以吃蔬菜、蛋类、瘦肉、稀饭、面条、馒头、米饭等食物。要吃辛辣食物和油腻食物，不要吃高脂肪食物。不要吃生冷的东西，注意小腹部保暖，保持心情舒畅，适当运动。
巧克力囊肿属于子宫内膜异位引起的，属于良性病变。主要症状是月经期增大，有可能出现腹痛。日常饮食注意多吃些蔬菜水果，不要吃含有激素、生冷、刺激性的食物，期间需要禁烟禁酒。如果巧克力囊肿的体积比较小，暂时可以先观察。但是如果体积比较大，需要及时手术。
注意多吃些蔬菜水果，不要吃垃圾食品，不要吃非季节性蔬菜水果，不要吃含有激素的食物，不要吃辛辣食物和油腻食物，不要吃高脂肪食物，可以吃蔬菜、蛋类、瘦肉、稀饭、面条、馒头、米饭等食物。