治疗女性卵巢囊肿一般采用手术切除的方式，但是多数病人不愿接受，因费用高、留伤口。切除后易在原来的部位复发或对侧又长出囊肿等缺点，不是恶性囊肿病人一般不会选择手术治疗。囊肿小于5cm。用中药丹桂消聚贴治疗可起到事半功倍的疗效。
卵巢囊肿多数是由妇科炎症引起的，先吃一些抗炎药物等月经干净，三天之后需要复查彩超，看是否有减小的趋势，囊肿大小不超过五厘米，如果有效果当然更好，如果观察超过五厘米，可以考虑手术治疗。
怀孕前卵巢囊肿可能是由于体内激素的刺激，导致卵巢囊肿增大，但是怀孕初期不会出现卵巢囊肿疼痛。
怀孕初期受体内激素的刺激，只会使囊肿增大，而不会引起囊肿的破裂和扭转。如果是卵巢巧克力囊肿，怀孕后卵巢巧克力囊肿会慢慢萎缩，所以卵巢巧克力囊肿不会引起疼痛，反而会随着孕周的增加而逐渐萎缩变小，甚至有可能是怀孕后自愈。
一般情况下，怀孕初期卵巢囊肿治疗要根据囊肿的性质和患者的症状决定。
1.如果囊肿直径在5cm以上，一般需要进行手术治疗，避免卵巢囊肿破裂引起急腹症。
2.如果是良性的生理性囊肿，囊肿直径在5cm以下，患者没有明显的临床症状，一般不需要特殊治疗。
日常生活中，应注意个人卫生，饮食清淡，作息规律，多休息，保持良好的心态，注意合理运动，增强自身的体质，有利于身体健康。
一般情况下，怀孕初期有卵巢囊肿可能是激素水平变化造成的，具体内容如下：
在怀孕后，女性体内激素水平变化，女性的卵巢会产生一种叫做“黄体”的物质，黄体会分泌一些激素来保证女性的正常孕期，这种情况下，黄体也会逐渐增大，可能会出现卵巢囊肿，这其实是黄体体积变大导致的卵巢的黄体囊肿。一般怀孕2个多月后，黄体就会慢慢的出现胎盘，这时候的卵巢囊肿就会慢慢的消失，因此，女性无需过度紧张，定期进行产检，明确自身情况即可。
