治疗女性卵巢囊肿一般采用手术切除的方式，但是多数病人不愿接受，因费用高、留伤口。切除后易在原来的部位复发或对侧又长出囊肿等缺点，不是恶性囊肿病人一般不会选择手术治疗。囊肿小于5cm。用中药丹桂消聚贴治疗可起到事半功倍的疗效。
怀孕前卵巢囊肿可能是由于体内激素的刺激，导致卵巢囊肿增大，但是怀孕初期不会出现卵巢囊肿疼痛。
怀孕初期受体内激素的刺激，只会使囊肿增大，而不会引起囊肿的破裂和扭转。如果是卵巢巧克力囊肿，怀孕后卵巢巧克力囊肿会慢慢萎缩，所以卵巢巧克力囊肿不会引起疼痛，反而会随着孕周的增加而逐渐萎缩变小，甚至有可能是怀孕后自愈。
一般情况下，怀孕初期有卵巢囊肿可能是激素水平变化造成的，具体内容如下：
在怀孕后，女性体内激素水平变化，女性的卵巢会产生一种叫做“黄体”的物质，黄体会分泌一些激素来保证女性的正常孕期，这种情况下，黄体也会逐渐增大，可能会出现卵巢囊肿，这其实是黄体体积变大导致的卵巢的黄体囊肿。一般怀孕2个多月后，黄体就会慢慢的出现胎盘，这时候的卵巢囊肿就会慢慢的消失，因此，女性无需过度紧张，定期进行产检，明确自身情况即可。
囊肿可以是生理性的（即是正常的随生理周期的变化可以自然消失的）或病理性的（由于疾病而形成的囊肿），生理性的囊肿无需手术，而病理性的囊肿，往往需要手术来明确诊断并作相应的处理。首先要明确是生理性的还是病理性的囊肿。去医院在复查B超看看。目前，彩色B超、X线检查、腹腔镜等先进诊断技术对卵巢囊肿病变可以早期诊断。卵巢囊肿虽然容易恶变，但只要做到早检查、早发现、早治疗还是可以避免的。
是常见的。卵巢囊肿的治疗，具体是视囊肿的大小来定的，从检查结果来看，囊肿较大了，药物治疗的可能性不大，是需配合手术摘除的。当症状比较严重、出血频繁且同时出现时，女性患卵巢囊肿的可能性更高，病变恶性卵巢癌的危害就更大。
卵巢囊肿，首先要确定是良性，还是恶性。如果囊肿小于6厘米可以保守治疗，如果囊肿比较大，需要及时手术，不会自愈的。一旦确诊为卵巢良性肿瘤，应手术治疗。按照病人年龄、生育要求及对侧卵巢进行手术方式的选择。
