小的卵巢囊肿可以用中药治疗。患者可以尝试服用活血化瘀的中药进行治疗，常用的中药有当归、茯苓、益母草等等。患者还可服用中成药如桂枝茯苓丸等进行治疗，但由于患者体质不同，对于中药治疗的效果可能会有不同。如果卵巢囊肿超过了5cm，药物治疗不会有明显的效果，需要进行手术治疗。恶性卵巢囊肿则需要尽早的进行手术治疗，切不可只服用中药耽误了治疗时机。
如果患者患有卵巢囊肿期间，出现了月经不调的情况，需要根据患者的实际情况进行用药。导致月经不调的原因有很多，中可能是身体虚弱、气血亏虚、饮食不当等因素导致的，可以遵医嘱选择乌鸡白凤丸进行调理，可以改善月经不调，有较好的效果。
如果是肝气郁结导致的月经不调，可以在医生的指导下选择逍遥丸，能够使病情好转。
卵巢囊肿可以用一些活血化瘀的中药治疗。卵巢囊肿可能会变小，或者如果不太大会自动消失，这不一定会影响生育能力。卵巢囊肿时，应注意生活规律，不要过度劳累，保持良好的情绪，少吃高激素含量的食物，并随着时间的推移重新检查。
治疗卵巢囊肿的中药主要是活血化瘀类的，常见的有当归、茯苓、益母草、桂枝、川穹等等，这些中药可能具有抑制卵巢囊肿生长的效果，甚至可使其缩小，常用的中成药有桂枝茯苓丸。需要注意的是，不同患者对中药治疗的反应不同，如果服用中药超过2个月，卵巢囊肿依然没有变小，可能需要进行手术治疗。但具体的治疗方案，需要去医院就诊后再确定。
如果是比较小的卵巢囊肿，患者吃中药有一定的效果，某些中药有抑制卵巢囊肿生长的作用，可以使卵巢囊肿缩小，可能会治愈，具体的用药方案或中药药方，建议咨询中医医师来确定。但对于超过五厘米或者恶性的卵巢囊肿患者，属于较大、较严重的情况，服用中药通常是没有效果的，部分西药的治疗一般效果也不明显，而需要及时进行手术治疗。
患有卵巢囊肿疾病可以用中药进行治疗，但是很难使囊肿消失，通常需要手术的办法，因为卵巢囊肿是增生性疾病，如果局部组织已经增生，仅凭使用中药治疗很难完全治愈，可以选择软坚散结、活血化瘀等中药进行治疗。
如果连续治疗两个月左右，病情没有恢复，卵巢囊肿没有减小，需要在医生的指导下考虑采取手术的方法，才能使卵巢囊肿消除。