多囊卵巢的治疗上主要以激素调节为主。首先要做相关的检查，于月经第2-3天行性腺六项、血糖及胰岛素抵抗的检查，根据检查结果进行针对性的治疗。可以通过口服天然雌激素与孕激素药物进行正常的人工周期调节，如果存在排卵异常情况，也可以通过促排卵治疗达到排卵的目的。
多囊卵巢和卵巢囊肿相比，多囊卵巢更为严重。是因为多囊卵巢属于内分泌疾病，常常是由于遗传因素和环境因素相互作用导致的，由于卵泡不能正常生长发育和排出，因此就会导致女性出现月经失调、面部痤疮，甚至肥胖等其他并发症，还可能影响女性的生育功能。卵巢囊肿可能是生理性囊肿，也可能是普通的卵巢囊肿，或者是子宫内膜异位症导致的卵巢巧克力囊肿这些疾病通过手术治疗以后往往都可以治愈，而且不容易影响女性正常受孕。
多囊卵巢综合症需要去妇科就诊，查阴道超声和抽血化验性激素六项amh就可以确定，遵医嘱按规律按疗程服药调理，体重超重控制饮食，减轻体重。平时要注意休息，多喝热水。
多囊卵巢综合症是最常见的妇科内分泌疾病之一，经治疗后可恢复正常的月经和生育。此病应控制饮食和增加运动降低体重和腰围，可增加胰岛素敏感性，降低胰岛素、睾酮水平，从而恢复排卵及生育功能。另外进行药物治疗来调节月经周期、降低血雄激素水平、改善胰岛素抵抗、诱发排卵等，或者进行手术治疗。
患有多囊卵巢严重的，是用手术治疗的。可以根据自己的实际情况进行卵巢打孔，但由于存在个体差异，不能保证手术后会痊愈，但症状可以改善，一般多囊在怀孕后症状是可以改善的。或是在医生指导下应用药物治疗都可以。