巧克力囊肿这种疾病对病人身体健康危害是比较严重的，这是一种比较常见的妇科疾病，发病人群大多是育龄女性。巧克力囊肿可以引起病人出现不孕，痛经，月经不调以及夫妻生活疼痛的情况，所以一定要及时去正规医院进行治疗。
如果巧克力囊肿直径小于五厘米，没有合并任何不适，可以定期的复查。如果巧克力囊肿直径大于五厘米，并且是持续存在，需要手术治疗。巧克力囊肿是一种良性病变、恶性行为，特别容易复发。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，是指子宫内含有陈旧性血液和巧克力差不多，主要是因为子宫内膜脱落，形成月经，月经周期反复脱落，可有局部的出血现象在卵巢里形成了积血，最后导致了巧克力囊肿的产生。初期的巧克力囊肿可采用药物治疗，并密切的随访复查，注意卵巢囊肿的变化。严重的卵巢囊肿者要给予手术治疗。
巧克力囊肿一般不是妇科炎症引起的。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症所导致的病变，正常的子宫内膜应生长在子宫腔当中，受到体内激素水平异常之后，就有可能导致子宫内膜随着经血逆流进入到腹腔当中，引起了巧克力囊肿的现象。一般和妇科炎症是没有直接关系的。
可以在医生指导下通过口服非甾体抗炎药来进行治疗，能够起到抗炎和镇痛的效果，病情比较严重的可通过手术的方法来改善。
巧克力囊肿可以采用手术治疗，手术可较为彻底地清除囊肿，而且通过手术的方式还可以有效的缓解痛经，提高生活质量，对于有不孕症的病人，手术后妊娠率能够得以提高。另外也可以采用中药治疗。
卵巢巧克力囊肿治疗费用在2000元-4000元。巧克力囊肿就是子宫内膜异位症引起的，对于巧克力囊肿的治疗，包括药物治疗和手术治疗，除了进行治疗的手术以外，其他的治疗方式都是有可能会复发的。巧克力囊肿的治疗费用，根据所处地区消费水平不同，就诊医院的级别和性质不同。