症状较轻的可以服用止痛药，或者服用高效孕激素和避孕药，症状严重者考虑手术治疗。对于年龄较大、有生育要求的，可以首先考虑手术治疗和促排卵指导受孕。子宫内膜异位症的治疗包括了手术治疗和药物治疗。治疗子宫内膜异位症需要每个病人的情况进行个体化的治疗。
子宫内膜异位症西医治疗方法有手术和药物两种：药物治疗，主要是口服激素，即假孕和假绝经疗法。手术治疗。用中医的辨证施治方法，使异位的包块要逐渐的液化。缩小、吸收，异位包块的缩小而减轻，或者全部消失。
于子宫内膜异位症而言，治疗方式，就是需要手术治疗的，热敷，药物，的确是有效果，也且些中医的疗法，但是并不能从根本上解决问题的，而且手术是有一定的风险的，当然也不要轻易的进行手术，关键还是需要看个人的身体状况，确诊后这样才好治疗的，不能忽视这个事情。
子宫内膜异位食疗在日常生活种可以多吃含n-3脂肪酸的鱼类，而且有些深海鱼含有11-3脂肪酸，也可以多吃雪菜，这些食物的物质能够有效的抑制前列腺素的产生，是一种天然的抗前列腺素的食物，吃起来更有益。
治疗方法分药物和手术治疗，效果较好的就是手术，分为保留生育功能手术和保留卵巢功能的手术。仅切除内膜异位病灶，保留卵巢和子宫。适用于年轻、想保存生育机能者。严重会切除的子宫附件和病灶，这样就会导致彻底失去生育能力。
手术与药物联合治疗：手术治疗前给予3-6个月的药物治疗，使异位病灶缩小、软化，有利于缩小手术范围和手术操作。对保守性手术、手术不彻底或术后疼痛不缓解者，术后给予药物治疗，推迟复发。保留生育功能手术：切净或破坏所有可见的异位内膜病灶、分离粘连、恢复正常的解剖结构，但保留子宫、一侧或双侧卵巢，至少保留部分卵巢组织。适用于药物治疗无效、年轻和有生育要求的患者。