灰指甲的治疗方法包括外用药物涂抹和口服药物治疗。轻度灰指甲可以用杀菌消毒的药物涂抹；中重度灰指甲需要配合口服药物治疗，根据灰指甲发病部位需要坚持服药3-6个月左右。如果采取口服药物治疗，建议病人到正规三甲医院，在专业医生指导下使用。
灰指甲应采取外用药物治疗，应该按照疗程有规律的进行治疗，坚持使用一个阶段。平时应该养成健康的生活和饮食习惯，比如注意休息，避免过度劳累和精神紧张，饮食应该清淡，平时应该适当的多饮水，多摄入新鲜的蔬菜及瓜果，避免辛辣鱼腥等刺激性食物。
轻度的灰指甲，比如很浅表的，没有明显增厚的，可以通过外用药来治疗。可以用冰醋酸，或者甲搽剂，像女孩子涂指甲油一样，涂在指甲上，但是含有药物的，还有一定渗透性。
治疗灰指甲的方法很多，灰指甲大部分是由真菌引起的，治疗灰指甲的药物都是能够消灭指甲真菌的，目前所采用的主要药物和方式是手术拔除指甲、内服药物和外用药物、中医治疗灰指甲。
灰指甲初期的治疗方法有：口服药物会对人体肝脏和肾脏造成负担，外用药物相对比较安全，但临床疗效不是很好，激光治疗，主要适用于不耐受口服药物的老年人。具体用药请结合临床，由医生面诊指导为准。