灰指甲属于真菌感染性疾病，主要应用于抗真菌药，吡咯类抗真菌药包括咪唑类和三唑类。
1.咪唑类药物有酮康唑，咪康唑，克霉唑等。
2.三唑类药物有氟康唑、伊曲康唑等，伊曲康唑具有高度亲脂性、亲角性、易口服、易吸收，药物在皮肤和指甲中的浓度迅速超过血浆浓度，皮肤浓度可以维持数周，甲素浓度持续6~9个月。用于治疗灰指甲。
3.特比萘芬是丙烯胺类抗真菌药物，它可以抑制麦角固醇在真菌细胞膜上合成角鲨烯环氧化酶，从而达到杀灭和抑制真菌的作用。
通常来讲，灰指甲包药后出现疼痛感属于正常现象，等待一段时间即可恢复正常。灰指甲是一种真菌感染引起的甲部病变，利用抗真菌的外用药进行包埋是比较有效的治疗方法，如果出现了疼痛的情况可能是药物进入了深层组织，疼痛会在一段时间后恢复，不用过于紧张。一般用于灰指甲治疗的外用药物常以亮甲牌复方聚维酮碘搽剂为主，作为一种治疗灰指甲的专用药，具有杀灭致病菌，抑制真菌再生的效果，可有效帮助灰指甲患者改善症状。症状严重时，可将亮甲联合丁克盐酸特比萘芬片、斯皮仁诺特比萘芬胶囊等抗真菌口服药物治疗。
灰指甲用药后有时也会疼的，这属于正常反应。因为灰指甲有轻有重，如果是很轻的话，就不会疼，如果严重了，用药后也会疼的。因为灰指甲恢复期是需要很长时间的。以选择使用其他的抗真菌的药物之类的药物，可以用清水清洗患处，可以去医院皮肤科就诊吧。
灰指甲是由于感染细菌引起的疾病，时间长了就会导致指甲增厚，颜色变深，可以使用抗真菌的药物进行涂抹，能够控制会是假的传染。灰指甲也可以通过手术的方式进行根除，不要吃辛辣生冷的食物，多吃水果蔬菜。注意观察自己的身体变化，如果出现异常应该及时去医院进行检查治疗。
灰指甲的出现与甲下真菌感染有关，其中红色毛癣菌、石膏样毛癣菌等皮肤癣菌为灰指甲的主要致病菌。因此，患者可以选用能够有效杀灭真菌的抗真菌感染的药物进行治疗。
常见的抗真菌感染药物多为外用搽剂，如亮甲牌复方聚维酮碘搽剂，该药物能够渗透甲下，作用于患处真菌，达到持续杀菌的功效。在用药期间，需按照说明书或医生指导严格使用。建议患者坚持长期规范用药治疗，有助于达到更好的治疗效果。用药期间，注意调整个人生活、卫生习惯，可帮助药效得以发挥。