常见的莫匹罗星乳膏、夫西地酸乳膏等对毛囊炎有效。
莫匹罗星乳膏、夫西地酸乳膏、甲硝唑凝胶、阿达帕林胶、红霉素软膏等软膏都可以有效的抑制毛囊内部杆菌增殖，抑制皮脂腺的分泌，破坏厌氧菌生长的环境，达到杀菌的效果，治疗毛囊炎。为了减少药物对皮肤的刺激，可以在上药之前，先使用保湿剂，增加皮肤的水合度。日常注意皮肤保湿补水。
毛囊炎治疗方法可以用药物治疗，可以去医院让医生诊断后开出药，按时吃，也可以用食疗方法，绿豆，冰糖适量。将洗净切碎，加水适量，煎煮15分钟，去渣取汁，加入洗净的绿豆，一同炖烂，加入冰糖调味即成。具有清热解暑，除烦止痒的作用。
治疗毛囊炎脱发可利用药物控制、养成良好的生活习惯等。
脱发性毛囊炎是一种炎症性疾病，本病多见于头部脂溢性皮炎，患者因感染金黄色葡萄球菌所致，可累及任何长毛的部位。临床上治疗一般外用抗生素和糖皮质激素软膏，而泛发性的损害，需口服抗生素。病情严重者，病需要糖皮质激素与抗生素融合用。如果已形成肿脓疱，患者应该在医生的指导下早日切开引流，并使用敏感性的抗生素，如此有利于治疗效果向好。患者的衣帽、毛巾、面盆禁止公用，防止接触传染。此外，还应对患者进行隔离，避免出现交叉感染的情况。
毛囊炎的治疗方法一般可以涂抹莫匹罗星软膏进行治疗，也可以服用抗生素类的药物改善。
毛囊炎多数是由于细菌感染引起的，涂抹莫匹罗星软膏通常能够起到促使局部炎症消退的作用，若是病情比较严重，还可以结合服用抗生素类的药物进行治疗，能够得到更好的治疗效果，有助于避免炎症加重。
在日常生活中要多喝些温开水，能够加快新的新陈代谢。
毛囊炎囊肿可以通过切开引流手术的方法治疗，做好术后的护理措施。
毛囊炎会出现皮肤有红肿或者是疼痛的症状，有些人还会伴有瘙痒现象，如果病情比较严重导致出现脓肿，需要通过切开引流手术的方法治疗，手术时进行注射麻醉药物，以免出现严重的疼痛症状。病情容易出现复发，要做好护理措施。
平常要避免接触特殊的化学物质，以免导致皮肤受到刺激。
手臂部出现毛囊炎大部分为细菌感染性毛囊炎，在临床中常见的为金黄色葡萄球菌。可以外擦抗感染的药物，如百多邦软膏、红霉素软膏，夫西地酸钠软膏或者复方氯霉素醇等。同时，一定要注意，不要抠、挤、刺激毛囊炎的皮损，否则会进一步的感染加重，发展成疖或者是痈等更严重的皮肤感染问题。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。