灰指甲的发生与真菌感染有着直接联系，因此治疗灰指甲需以抗真菌为主，药物具体包括外用抗真菌药和口服抗真菌药两大类。
灰指甲的诱发因素大部分与受免疫力低下、甲部外伤、生活卫生不佳等有关，真菌侵入甲板后大量繁殖并破坏甲部组织，引起甲板颜色及形状改变。因此，患者应选用抗真菌药物对症治疗。如亮甲复方聚维酮碘搽剂，其是一种治疗灰指甲的专用外用药，可起到杀菌抑菌、消炎止痒的作用，患者可根据药物说明按疗程用药，可达到较为显著的治疗效果。
此外，若患者已经出现了甲板脱落、甲板易碎等症状时，建议与口服抗真菌药进行联合治疗，如特比萘芬、氟康唑等，可进一步抑制真菌繁殖，从而促进甲部健康恢复。
灰指甲是一种真菌感染性的疾病，主要是真菌感染了指甲以后导致指甲增生变厚，变软。颜色发红或者发灰等。这种疾病治疗的话，建议在软化或去除病甲后局部外用抗真菌软膏（洁宁盐酸布替萘芬），还可外用冰醋酸，碘酊等.病甲要不断清除，直至完全正常甲长出，一般要坚持半年以上。
出现灰指甲是真菌感染导致的疾病，多见于患有脚气等真菌感染性疾病的人，可以使用灰甲净，亮甲等药物进行治疗，另外如果有脚气，需要同时治疗，使用对症的药物进行治疗，注意脚部卫生，保持脚部干燥，注意鞋袜的卫生消毒。
藿香正气类的药物是不可以治疗灰指甲的，灰指甲是由于真菌感染引起的，所以需要使用除菌的药物治疗。需要去正规的医院做相关的检查，然后让大夫看病人的病人来通过药物治疗，或者开一些相关的治疗治好了灰指甲，而且藿香正气类的药物并没有抗菌消炎的药物作用，所以对真菌没有治疗效果，并不能治疗灰指甲。
灰指甲是真菌感染而导致的，多表现为指甲变脆，有白斑，有增厚，有指甲变形，有颜色改变等表现，需要及时去皮肤科进一步的检查一下真菌，在医生指导下根据症状及时的对症治疗定时复查。