直肠炎的治疗，主要包括两方面：一个是修复人体的肠道黏膜；第二个是缓解临床症状。胃肠炎的人在行肠镜的检查过程中，一般可以发现直肠黏膜有充血和糜烂。在治疗上，需要使用一些药，来修复肠道黏膜。
慢性直肠炎大多与不良的生活饮食习惯和便秘有关，饮酒刺激也是造成慢性直肠炎的原因之一。应该到正规的公立性医院检查，查清病因，可以采取抗生素治疗，配合服用消炎药物治疗。要清淡饮食，多吃蔬菜和水果，避免油腻辛辣刺激性食物，避免烟酒刺激。
直肠炎可以治疗。EGF阶梯免疫重组治疗直肠炎更快更彻底。它不仅保证了疾病的治疗，而且阻断了炎症反应，调节了免疫功能，增强了机体的免疫力，同时构筑了新的肠粘膜健康屏障，调节了肠内和胃内菌群的平衡，增加了有益细菌，使肠道疾病得以缓解。EASES不会复发，达到心理学和生理学的双重健康标准。
一般情况下，艾灸肛门对直肠炎的治疗，能达到辅助治疗的效果。
直肠炎多由肠道内菌群失调、有害菌滋生引起，而艾炙通常无杀菌、消炎之功效，故艾灸无法直接用于直肠炎，只能起到辅助治疗的作用。直肠炎以药物治疗为主，在平时要注意生活作息规律，尽量不吃辛辣刺激性食物，不要滥用抗生素，以免对肠道正常菌群造成损害，这样才能控制直肠炎病情。
直肠炎的治疗有灌肠，对于粪便硬块嵌顿导致的直肠炎应采取灌肠，解除粪便压迫。由于引发直肠炎的病因较复杂，治疗原则应根据引发直肠炎的病因及疾病采取相应的治疗措施。可以通过粪便、涂片或活检组织进行细菌、真菌和病毒检测；相关抗体及毒素测定。要注意休息和饮食。
直肠炎栓是可以治疗直肠炎的，栓剂作用比较直接效果也是比较好的，平时也可以去附近医院中医科诊脉，看看舌苔，辩证调理中药汤剂灌肠治疗等，平时需要，消除各种可能致病的因素，如避免进食对胃黏膜有强刺激的饮食及药品，避免辛辣刺激食物，避免油腻的食物，戒烟忌酒。注意饮食卫生，防止暴饮暴食。