任由肛瘘发展，会对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。肛瘘的多发会形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有癌变的可能。肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
引起肛周脓肿的病因较多，主要原因有以下几个方面：1、感染性因素：感染是引起本病的主要原因。2、医源性因素：临床上属医源性引起的肛门直肠周围脓肿也不少见。3、手术后因素：临床上亦可见到肛门直肠手术引起感染，而形成的直肠周围脓肿。4、其它：直肠内异物损伤后感染，放线菌病，直肠憩室炎感染，肛管直肠癌破溃或波及深部的感染，及身体虚弱，抵抗力低下。
肛周脓肿是由于肛腺感染引起的，由于肛窦开口向上，像口袋一样，可以存留粪便，容易引起肛窦发炎，感染蔓延至肛腺后导致括约肌的肌间感染，从而引起各种类型的肛周脓肿。需要到医院就诊。
肛周脓肿不会自愈，应该考虑需要手术治疗，如果不积极治疗，肛周脓肿破溃后会形成肛瘘，这种症状也需要手术治疗。确诊肛周脓肿后，积极手术治疗，需要应用抗生素药物，手术后积极的换药，大部分都能一期愈合，保持肛门清洁。
对工作学习的影响：肛周脓肿发作时局部持续性的剧痛常使人坐立难安，严重干扰正常工作和学习。脓肿破溃后会造成脓水外溢，污染内裤，造成局部不适感。发展变化至更严重，少数病例会发展为肛周坏死性筋膜炎，这是一种严重的急性肛周皮下筋膜层的感染，发展迅速，可导致感染中毒性休克甚至危及生命，病死率为20%至50%。
引起肛门失禁：肛周脓肿不可小视，因为它会引起肛瘘，而如果不及时的治疗，便会对括约肌造成严重损伤，如此一来就可能造成肛门失禁以及其他的严重并发症出现。出现流脓症状：肛周脓肿一旦形成肛瘘，那么就会引起肛瘘发炎，除了会出现肛门剧烈疼痛的情况，破溃后还会出现流脓，并且脓水会污染到内裤，浓汁刺激到局部的皮肤，肛门瘙痒变得更为剧烈。