肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食可以内生湿热所以不宜多吃，应多吃清淡含丰富维生素的食物，肛瘘多是肛周脓肿的后遗症，而肛周脓肿又与肛窦炎和肛腺炎有关。尽量避免发生以及早期治疗肛窦炎和肛腺炎，使不致转变成肛周脓肿，是减少产生肛瘘的重要因素。养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁对预防感染有积极作用。
肛瘘的护理主要是术后的护理：适当活动。肛瘘的病者术后应尽早的下床活动，适当的活动有利于促进肠蠕动，有利于大便排出，也有利于防止下肢静脉血栓的形成，还可以促进切口创面的分泌物的引流；要注意保持切口创面以及周围皮肤的清洁和干燥。肛瘘病者术后的创面分泌物一般是比较多的，感觉到潮湿，切口外的纱布要勤换，每天清洗肛门及周围的皮肤2-3次；出血：所有的手术进行手术操作之后都会有出血的可能，肛瘘也是一样。
得了肛屡通过手术的治疗的，手术之后一定要按时进行换药，注意保持创面引流通畅，同时要多喝水，多吃新鲜的蔬菜和水果，尽量避免疲劳和熬夜。需要加强肛门的护理，肛部支撑垫帮助悬空伤口，促进水肿消退。饮食要清淡，少吃辛辣油腻的食物，保证大便通畅。
术后的二十四小时之后，要将伤口里面的填充物取出来，按时服用抗生素。肛瘘术后四十八个小时之后促进排便。日常要适当地做肢体动作，可以增强体质，对伤口的恢复更加快速。
肛瘘的护理主要是保持肛门部的清洁，避免肛瘘发生感染，形成脓肿。可以每天清洗肛门。主要是手术治疗，非手术治疗适用于不能手术的病人，因为肛瘘主要是由内口、外口和瘘管组成，非手术治疗只能是急性期消除炎症，不能消除瘘管，所以效果不好。