肛瘘的危害很大，一旦患有了肛瘘以后，都会特别的痛苦。而且一旦肛瘘形成，自愈的机会极少，瘘管复杂化后，带来许多麻烦与一定的危害性。当如果选择好的医院，先进的技术是可以治好不复发的。
只有手术才能治疗好肛瘘。对于低位肛瘘可以选择瘘道切开一次性治疗；对于高位肛瘘，复杂性肛瘘，直肠粘膜下瘘应选择瘘道切开内口挂线术，术后给予抗炎药物，术区换药及温水坐浴等对症治疗；少数肛瘘可行瘘道切除术后一期缝合或游离植皮。
肛瘘的治疗主要是进行手术，保守治疗不能好，可根据肛瘘具体情况选择挂线疗法、瘘管切开术、肛瘘切除术，从资料来看可能是瘘管切开术，具体情况可咨询手术医生，术后定期换药，去除脓性分泌物，如有必要可应用药物治疗，忌酒辛辣食物。
治好肛瘘的基本标准就是肛门能正常排便，伤口基本愈合。在伤口愈合期需要注意保持大便通畅，尽量吃流质和软食。对于伤口严重愈合期时间会长一点，建议平日活动量减少，偶尔步行活动，增加肠蠕动即可。术后病人要注意随时监测体温，术后要保持肛门的清洁避免感染，遵医嘱给予一些肛门栓剂，或者每日药物清洗肛门。在术后第一次排便期，会感觉疼痛难耐，属正常现象，若是便秘可以用一些肛门润滑剂。
一旦确诊为肛瘘，唯一有效的方法就是手术的，除此之外没有任何保守疗法的，可以选择微创无痛手术的。建议多注意观察目前的情况，可以使用碘伏液进行擦拭消毒。疼痛感会随着时间慢慢减少减小。恢复需要一个多月的时间。