肛周脓肿的大小还有深浅范围不一样，恢复的时间也就不一样，大部分需要在三到四周才能基本愈合，如果伤口很大，可能恢复的就比较慢。平时要注意多吃营养丰富、易于消化的食物，不要吃不干净的食物，规律生活作息，避免熬夜。
一般治疗肛周脓肿仅需一次手术就能有效果，肛周脓肿是肛瘘的早期阶段，由于感染源部位（内口）多不明显，所以在治疗方法不全同于肛瘘，目前通行的办法是两次手术，即首先切开排脓，待数月后内口明显、瘘管形成再按肛瘘论治。本病手术的两个关键依然如何寻找内口和保护肛直环一般不影响性生活。
肛周脓肿能完全康复。肛周脓肿的处理原则是切除病变的肛隐窝，尽可能探寻内口所在。切开引流彻底清创暗腔，所有症状可随切开引流而消失。术中选择1点、11点切口，此部位脓肿多见于皮下和括约肌间隙脓肿。脓腔清创引流，脓肿暗腔清除与切除肛隐窝、选择切口有着同等意义，这是过程中的一个非常重要的环节，不容忽视。
注意休息，多喝水，多吃水果蔬菜，不要吃辛辣刺激性的食物，使用药物坐浴，口服几天消炎药，预防感染的现象有利于病情的恢复。注意休息不要长期久坐工作劳累，注意肛门清洁卫生，便后温开水清洁坐浴，可以考虑当地正规综合性医院肛肠外科肛检复查，进一步处理。
术后会有明显的疼痛，尤其是在排便的时候。伤口会有局部的渗出。要进行定期的换药。也可以使用温水坐浴，肛周脓肿手术治疗主要是进行切开引流。伤口使用油砂覆盖，不能进行一期的缝合。注意多吃蔬菜，多喝水，少吃辛辣的食物，适当进行户外运动。
