肛周脓肿起病急，症状明显，痛苦大，要想治疗肛周脓肿，只能通过手术的方法进行治疗。手术治疗主要采用抽脓减压、切开排脓的治疗方法，根据不同位置的肛周脓肿，采用不同的手术方式：低位脓肿－直接切开；马蹄脓肿－切开加旷置；高位脓肿－挂线术；高位脓肿-等压引流术，药物治疗：可以口服抗生素、使用外用药物或者内用药物进行治疗，主要起辅助作用。
肛周脓肿如果已经化脓，可以采取手术治疗，手术就是需要切开引流，平时注意保持局部清洁卫生，饮食忌辛辣忌烟酒，多吃富含蛋白质的食物。肛周脓肿是肛门周围软组织间隙的一种化脓性感染。处理不当容易形成肛瘘。
患上肛周脓肿时，在多数情况下，脓液会破坏健康的皮肤组织，病变的地方也会慢慢扩大。假如破坏直肠粘膜，脓液就会进入肛管内部，也有可能按原路返回肛管，这就是从肛门小窝排脓，但多数情况都是向皮肤破溃，这就是所谓的自然排脓。
先感到肛门周围出现了一个小硬块或肿块，继而疼痛加剧、红肿发热、坠胀不适、坐卧不宁、夜不能眠、大便秘结、排尿不畅成里急后重等直肠刺激症状；并随之出现全身不适、精神疲惫乏力、体温升高、食欲减退、寒战高热等全身中毒症状。肛周脓肿的病人禁忌酒、辣椒、生姜、大蒜、肉桂等，这些均属辛辣之品，可刺激局部发炎，加重肛门直肠周围脓肿的病情。
局部热敷等方式促进炎症的吸收。要保持肛门周围清洁，排便以后使用温水清洗干净，预防便秘的发生，加重肛周脓肿的症状。多吃一些富含纤维素的食物，不要吃辛辣刺激的饮食，不要饮酒，别着凉。
少数肛周脓肿药物，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗。平时应该注意不吃辛辣刺激，注意局部卫生，饮食以清淡易消化为主，禁食辛辣刺。激性油腻食物，适当补充营养。
