任由肛瘘发展，会对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。肛瘘的多发会形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有癌变的可能。肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
肛门周围软组织空间的化脓性感染，治疗不当很容易形成肛瘘。早期输液，抗炎治疗。如果已经形成脓液，应及时切除引流治疗。生活规律一些，多注意休息。清淡饮食，多喝水。避免油腻、辛辣和刺激性食物，不要挤压患处。
肛周脓肿造成的云饮食细菌感染，细菌感染是饮食肛周脓肿的致病因素，肛周皮下脓肿的主要感染途径是肛窦和肛缘皮肤，会阴筋膜下脓肿和会阴筋膜下脓肿主要的感染途径是肛门前侧齿线处的肛窦和裂伤的肛管皮肤，平时要有良好的卫生习惯，勤洗换内裤，保持肛门的干燥和清洁。
有时候压力大或者过度紧张或者在饮食上喝酒、吃辛辣的东西会感觉肛门周围突然的肿痛。所以肛周脓肿有很多诱因，与引起体内湿热上火的因素关系较大，所以发病是年轻的男性居多。
肛周脓肿不会自愈，应该考虑需要手术治疗，如果不积极治疗，肛周脓肿破溃后会形成肛瘘，这种症状也需要手术治疗。确诊肛周脓肿后，积极手术治疗，需要应用抗生素药物，手术后积极的换药，大部分都能一期愈合，保持肛门清洁。