小儿慢性肠炎的发病率很高，一般是因为病毒感染而导致的，一般情况下，小儿慢性肠炎的治疗主要根据病毒和非侵入性细菌来判断。
临床表现出明显的中毒症状，尤其是新生儿、婴幼儿、重症患儿可选用抗生素。抗生素不能治疗由病毒引起的肠炎。治疗由寄生虫引起的肠炎需要服用一些抗寄生虫的药物。可以适当选择胃肠粘膜保护剂和微生态治疗。
慢性肠炎吃以下药效果比较好：
慢性肠炎是肠黏膜的慢性炎症。建议慢性肠炎的患者在医生的指导下服用蒙脱石散、固肠止泻丸、盐酸洛哌丁胺胶囊等药物进行治疗。此外，茯苓、白术、苍术、黄芪、五味子、陈皮、桔梗、赤小豆等中药也有助于改善症状，建议患者在医生的指导下合理服用。
建议慢性肠炎的患者平时要注意腹部保暖，还要注意多休息，早睡早起，有利于身体健康。
慢性或反复发作的腹痛、腹泻、消化不良等是儿童慢性胃炎的常见表现，临床表现为粘性或水样便。在护理上，要做到劳逸结合，不要过度疲劳，平时要注意保暖；可以通过适当的运动来提高身体素质。可以吃一些容易消化、营养丰富、卡路里充足的食品。不要吃生冷油腻多纤维食品。要选择一些帮助消化的药物，或者是保护胃黏膜的药物。
通常来说，慢性肠炎肚子疼吃枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、阿托品、山莨菪素等药。
慢性肠炎肚子疼可能是由于长期的炎症所致的肠神经受到了刺激导致的，可以口服枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等调节肠道菌群的药物，还可以配合阿托品、山莨菪素等解痉镇痛类的药物。平时也要避免食用过多的生冷和辛辣的食品，避免对肠胃造成刺激，导致病情恶化。
慢性肠炎是有由细菌、病毒或者寄生虫引起的胃肠道疾病。治疗慢性肠炎时需根据细菌药物敏感实验结果选用合适的抗菌药物。还有就是需要补充足够的液体以及纠正电解质和酸中毒。建议在日常生活中要有良好的用餐习惯，不吃变质和不干净的食物。养成餐前便后洗手的习惯。
