在平时可以采取坐浴的方式来减少脓肿，如果囊肿已经有脓液，可以通过手术的方式来进行治疗，对于这类疾病一定要尽早的进行治疗，以免引起其他功能疾病，平时在饮食上尽量以清淡为主，不要吃一些刺激性和辛辣食物。
肛周囊肿形成的常见原因是肛裂、大便干燥或用力排便等引起肛管直肠内微小损伤，肠道内细菌可经过损伤处的肛腺浸入到肛管直肠周围间隙而形成感染，进而形成脓肿。如果脓肿的位置较深，则可能有发热、乏力等全身症状，肛周部的疼痛红肿往往不太明显。肛管直肠周围脓肿一般不能自行痊愈，如任其发展，最终脓肿将向肛周皮肤或肛管直肠腔内破溃形成肛瘘。应该多吃水果蔬菜维生素含量高的食物。
可以适用中药调理，中药副作用相对比较少，与术后炎症没有关联，中医诊断考虑为脾胃湿热引起的肛周脓肿。肛周囊肿的表现需要注意积极的使用手术进行切除为好的。尽量的注意不要最近有感染的现象出现，多吃些清淡食物。
肛周囊肿治疗主要采用手术方法。位于肛门口或者肛周皮下的囊肿，可以选择切开，并且要仔细地分离病变，避免残留。手术以后还需要抗感染治疗，在围手术期应该叮嘱病人流质饮食，避免形成干质的粪便，以免导致局部的污染。治疗是定期进行换药，注意局部卫生。
肛周囊肿可以采取手术治疗，饮食上应以清淡并含有较多纤维素的食品为宜，如菠菜，芹菜，冬瓜，丝瓜，南瓜，绿豆，黄豆，油菜，黄花菜，海带，萝卜等。均有清热解毒的功效，能缓解肛肠肿痛，流脓流水等特征。