肛肠囊肿就是平时说的肛周脓肿，它主要是因为肛腺感染沿着直肠或者肛管蔓延。肛周脓肿的治疗早期切开引流，这是控制感染的关键。如果症状不是特别明显，脓肿形成不是特别彻底，也可以采取非手术治疗。
如果恶性程度比较低的鳞癌或者基底细胞癌，肿瘤直径小于两公分，可以进行肿瘤局部切除，可以行局部的扩大切除，术后送检病理。如果切缘呈阴性，定期门诊复查即可。如果肿瘤体积比较大，恶性程度比较高，应当行经腹会阴联合切除，乙状结肠造口术，需要清理腹股沟、肠系膜周围淋巴结，术后根据病理情况决定是否需要放疗或者化疗，也可以应用中药辅助治疗。
肛肠类疾病应该根据疾病类型给予治疗，如果形成痔疮、肛瘘、肛周脓肿等良性肛肠疾病，应该及时到正规医院就诊，排除恶性疾病，在疾病早期需对其进行阻断预防，以免耽误治疗时间。对于痔疮的治疗，提倡外剥内扎术式，其治疗效果好，损伤最小，后遗症也最少，包括肛瘘、脓肿等疾病，主张用传统的治疗方法，采用切开、挂线技术，能够达到治疗疾病和保护肛门功能的完美效果。
一般情况下，直肠炎主要是因为肛管发炎，主要是因为长时间的排泄、大便中的病菌被直肠所吸附或者是长时间的拉肚子引起的。需要到正规的肛肠专科医生进行全面的检查，确定病因，并对症进行相应的处理。平时要注意保持良好的作息时间，不要经常熬夜，多做运动，提高身体免疫力，防止细菌感染。另外要注意保持好的排便方式，每日定时大便，之后要注意清理肛管，防止肛管上有残余的粪便，可以使用湿纸巾擦干净。平时要多吃一些辛辣、刺激性的东西，不要吃生冷的东西，有利于身体健康。
肛肠息肉西医治疗手术治疗摘除息肉的方法主要是内镜下行各种摘除法。根据息肉的形态、大孝数量及蒂的有无、长短粗细而分别采用不同的手术方法。肛肠息肉的原因可能与肛管内的刺激和炎症有关。