任由肛瘘发展，会对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。肛瘘的多发会形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有癌变的可能。肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
先感到肛门周围出现了一个小硬块或肿块，继而疼痛加剧，红肿发热，坠胀不适，坐卧不宁，夜不能眠，大便秘结，排尿不畅成里急后重等直肠刺激症状。并随之出现全身不适，精神疲惫乏力，体温升高，食欲减退，寒战高热等全身中毒症状。
高位肛周脓肿是指位于肛门外括约肌以上的肛周脓肿。高位肛周脓肿一般全身症状会比较重。在临床上常见的症状可能出现发热、头痛等症状。这主要是细菌感染后出现的全身毒素反应。对于高位肛周脓肿的手术治疗。直接进行切开，敞开脓腔时需要谨慎，可能会引起肛门失禁大多数高位肛周脓肿都是采用切开脓腔加挂线的治疗方法进行治疗的。
肛周脓肿初期症状主要是哭闹，接触肛门或排便时哭闹加重。随着脓肿形成，可以见到肛周红色肿块，起初肿块质硬，逐渐肿块中间变软破溃溢脓，形成肛瘘，这时患儿哭闹减少，破溃口会反复溢脓。婴儿肛周脓肿大多发生于腹泻患儿，形成脓肿时间较短，2-3天可以见到肿块。婴儿肛门护理十分重要，排便后及时清洁肛门，吸水性能好的湿巾湿布蘸净水分，不要反复擦拭，擦拭肛门不当，容易引起损伤。
肛周脓肿的表现症状会出现发热，红肿，浑身无力，食欲不振，瘙痒等症状，肛周脓肿可以配合医生口服一些药物来治疗，严重的情况下还需要通过手术的方法来治疗，肛周脓肿通常是便秘导致的一种疾病，新鲜的蔬菜和水果，多吃苹果。