小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
腹泻婴儿可分为两类，即感染性肠炎和消化不良。首先，你需要去医院做常规大便检查。如果大便有炎症，你应该考虑肠炎并使用抗炎药物来控制感染。如果婴儿年龄较小，且反复肠炎，也应考虑乳糖不耐受或肠道过敏的可能性。
大便常规正常，宝宝肠功能紊乱会腹泻、病毒性肠炎也会腹泻，但病毒性肠炎一般一周会好转，因此宝宝肠功能紊乱可能性大。饮食要注意。母乳喂养时喂予前半部分奶，后半部分奶挤掉。并且奶胀了再喂。不够可喂予腹泻奶粉或米汤或稀粥，米汤要新鲜米煮的粥汤，应该会好转。
小儿腹泻用推拿就能治愈。具体的分析如下：
小儿推拿能治腹泻。另外，推拿还能够促进脾胃功能和肠道蠕动，提高消化能力。推拿主要通过对小儿身体上特定穴位的推拿来进行治疗，达到调理消化系统之功效，同时调理脾肾功能，从而使小儿腹泻症状得到改善。同时，推拿还具有促进新陈代谢，增加免疫力的功效。推拿因无需吃药，还可避免因服药而产生副作用。小儿腹泻推拿常以清大肠为法、清小肠，还有揉小天心，揉内八卦，然后搓龟尾、下推七节骨等，这些技巧对腹泻均有良好疗效。
虚寒腹泻通常仍可用药，经常使用的药是妈咪爱，培匪康也有丽珠肠乐之类的口服。还可以使用蒙石脱散、乳酸菌素片、乳酸菌素颗粒、肠炎宁片等，可以缓解身体不适。
小儿腹泻按其病因分为感染性与非感染性2类，它是一种以腹泻为主要表现的多因素、多病原所致的临床综合征，平时应注意保暖以免感冒。用药期间患者应该注意休息，规律作息，避免熬夜，并且注意保暖，避免着凉，避免吃辛辣、刺激的火锅、冰淇淋等食物，以免影响药效。