进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
肛肠检查大约需要300元-1500元不等。地区不同价格也会有所差异。肛肠疾病是临床常见病，多因不良的大便习惯和饮食习惯而诱发。肛肠疾病通过保守治疗能够缓解症状，必要时手术治疗。
肛肠检查有常见的有肛门视诊是肛肠检查的第一步。直肠指诊，可以触摸观察是否有直肠息肉、直肠腺瘤甚至一些位置比较低的直肠恶性肿瘤。还有置入肛门镜检查，肛门镜检查可以明确地观察直肠粘膜是否有感染，是否局部存在裂口。
肛肠科检查方式有很多种，可有肛门视诊，即用拇指轻轻分开病人的臀部，观察肛门及肛周有没有脱出物、外痔、外口、脓肿，也可以看到肛门周围有没有色素沉着，有没有裂口，如果有裂口，应该观察一下裂口的位置、裂口的种类及个数。
一般来说，肛肠镜检查通常在80-100元左右。
肛肠科检查一般包括肛门直肠镜和直肠镜检查，主要就是通过对患者进行清洁灌肠，做好肠道准备，通常患者进行一次肛肠镜检查，合计费用大概为80-100元左右，但是具体的费用通常和当地消费水平、选择的医院等因素有关，建议患者前往正规的医院进行肛肠镜检查，以免出现检查结果有误的情况。