引起肛周脓肿的病因较多，主要原因有以下几个方面：1、感染性因素：感染是引起本病的主要原因。2、医源性因素：临床上属医源性引起的肛门直肠周围脓肿也不少见。3、手术后因素：临床上亦可见到肛门直肠手术引起感染，而形成的直肠周围脓肿。4、其它：直肠内异物损伤后感染，放线菌病，直肠憩室炎感染，肛管直肠癌破溃或波及深部的感染，及身体虚弱，抵抗力低下。
任由肛瘘发展，会对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。肛瘘的多发会形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有癌变的可能。肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
有时候压力大或者过度紧张或者在饮食上喝酒、吃辛辣的东西会感觉肛门周围突然的肿痛。所以肛周脓肿有很多诱因，与引起体内湿热上火的因素关系较大，所以发病是年轻的男性居多。
肛周脓肿早期可以用消炎药等脓肿形成后就需要手术引流加上应用抗生素，否则脓肿迟早会自行破溃，相当手术切开引流，病情会延长，或者炎症扩散，如果是脓肿，手术治疗比较好。
肛周脓肿的治疗应根据不同情况选取不同的方法，中药治疗方法包括：在未成脓阶段，以消为主，通过清热解毒、软坚散结的药物使脓肿尽快消散；在成脓阶段，通过托的方法，包括补托法、透托法，使脓液尽早排出、排净，达到目的；在后期阶段，以补为主，通过补益气血，促进局部生肌长肉，尽早愈合。