预防肛周脓肿或肛瘘首先注意饮食卫生，对于辛辣刺激燥热生硬的食物要少吃，以免诱发大便干燥或者是腹泻，进而损伤肛门直肠黏膜导致感染发炎，或者是粪渣污染肛窦引起肛窦炎，从而形成肛周脓肿。
平时注意局部卫生，勤换内裤，便后清洗肛门，积极治疗与肛周脓肿有关的疾病，如果肛门出现不适时，尽早诊治。不吃或少吃刺激性食物，多吃容易消化又营养丰富的食物，多吃新鲜蔬菜，不吃变质食物，以预防肠道传染病，注意休息，防止过度疲劳，增强机体抵抗力，防止便秘，从而达到预防肛周脓肿的目的。
小儿肛周脓疡并没有最好的处理方法，只能选择对其进行最好的处理，通常采用的是保守疗法，外科治疗。
非手术疗法
1、婴儿的肛周脓肿的情况比较轻，可以使用外敷的药物，例如外敷的红霉素。2、用热水来进行坐浴，尤其是在大便之后要用清水清洗，可以通过热水坐浴来加快局部的血液流通，也可以到正规的医院进行物理理疗。
2、外科疗法
如果小儿的肠管出现了严重的脓疡，应立即进行开腹引流，以免发展为肛漏。术后要注意使用抗生素，同时要注意肛周的卫生。
想要预防肛周脓肿，首先就要增强自身的体质和抗病能力，多参加体育锻炼，不要久坐、久站。促进肛门附近的血液循环。可以多吃一些粗纤维的食物，粗粮和青菜都可以预防肛周脓肿。
养成良好的卫生习惯，养成每日便后洗洁局部的习惯，防止感染。不要久坐湿地，在草地、湿土上久坐，肛门部受凉受湿，对肠结核、克隆氏病、溃疡性大肠炎等全身疾病要积极治疗。
饮食方面要以清淡为主，不要吃辛辣刺激性食物，少饮酒，多吃蔬菜水果，多吃含高纤维食物，保持大便通畅，以防便秘。同时不要久坐，适当运动，避免引起痔疮等导致肛周脓肿的发生。注意卫生。
