一旦脓肿形成，需要进行手术治疗。最常见的手术方式就是切开引流手术，在穿刺抽到脓液后切开皮肤至脓腔内，彻底引流脓液，填塞凡士林纱布压迫，之后定期进行换药。有医生在手术当中，为了避免继发性的肛瘘形成，减少病人的二次手术痛苦，还会进一步寻找内口，一并进行处理，比如进行挂线手术，这样可以取得更完美的治疗效果。
如果已经比较严重的就一定要手术治疗，局部切开引流，然后再清创换药，日常的生活中不要吃一些过于辛辣刺激油腻的食物，还是要以清淡饮食为主，多吃新鲜的蔬菜水果，或者维生素含量比较高的蔬菜。
早期症状很轻微，具有肛门部不适或沉重感，继则肛缘有一突起包块，出现剧痛，有时伴有全身症状，如果脓肿位于前侧可出现排尿困难。去专业正规的医院进行检查和治疗。肛周脓肿的情况治疗的时间会比较长，所以一定要有足够的耐性，要等炎症和疾病症状完全消除后再停止治疗，否则很容易就会有复发的情况发生。
肛周脓肿能完全康复。肛周脓肿的处理原则是切除病变的肛隐窝，尽可能探寻内口所在。切开引流彻底清创暗腔，所有症状可随切开引流而消失。术中选择1点、11点切口，此部位脓肿多见于皮下和括约肌间隙脓肿。脓腔清创引流，脓肿暗腔清除与切除肛隐窝、选择切口有着同等意义，这是过程中的一个非常重要的环节，不容忽视。
进行了肛周脓肿的手术，将脓肿切开引流后，去除坏死的组织及感染化脓的组织，会造成肛周大面积的创伤，要经过炎症水肿期，肉芽生长期，皮缘生长期三个阶段，大约要4-6周的时间。
肛周脓肿是细菌感染，肛内有原发感染灶，确诊后需要手术治疗，保守治疗只能延误病情。不同地区价钱是不一样的，肛周脓肿所选择的手术方式不同，它的价钱也是不一样的，可以去当地的医院咨询一下。各地区医院医保报销的比例也不同。患有肛周脓肿，平时一定要注意保养，每天要用清水清洗肛门，温水坐浴。平时要多喝水，要尽量避免辛辣和烟酒刺激。少食油腻食物，不要久坐久立。