肛周脓肿和肛瘘是一样的，有一定的复发率，跟脓肿复杂程度有关系。临床上见到的比较简单的脓肿复发的几率是很小的，就像简单的肛瘘是一样的道理。越复杂的可能复发的几率就越高。
如果是单纯的肛周脓肿切开引流手术，往往由于没有处理内口或者内口难以处理，容易继发形成肛瘘，之后如果肛瘘外口发生堵塞，在引流不通畅的情况下，有可能再次发生肛周脓肿。如果肛周脓肿切开引流手术时，一期处理好内口，进行挂线手术，则可以大大降低复发的可能性。
如果是单纯的肛周脓肿切开引流手术，往往由于没有处理内口或者内口难以处理，容易继发形成肛瘘，之后如果肛瘘外口发生堵塞，在引流不通畅的情况下，有可能再次发生肛周脓肿。如果肛周脓肿切开引流手术时，一期处理好内口，进行挂线手术，则可以大大降低复发的可能性。
肛周脓肿术后会不会复发，看手术方法，如果做了脓肿的切开排脓，形成肛瘘以后需要再做手术。还要看一下肛周脓肿的病因，有些肛周脓肿病人有糖尿病、全身免疫系统疾病或者炎性肠病，溃疡性结肠炎，像牙齿烂了一颗以后，其它地方再有炎症感染，形成脓肿，可能就要再发，也不一定复发，所以要区别开，一个是复发，一个是再发，同一个部位再次感染化脓，叫复发。
肛周脓肿是肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿；临床上以大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌和绿脓杆菌，偶有厌氧性细菌和结核杆菌等病菌较常见。肛周脓肿是容易复发的，手术后只有找到内口后就可以治疗了，肛周脓肿反复的发作就可以找到内口，找到内口后切开就可以不用治疗了，以后就不会复发了。
肛周脓肿经过手术以后，是有一定的复发率的，它的复发率经过统计，一般是在2%-5%之间。肛周脓肿术后复发的原因有以下几点：第一就是肛周脓肿位置过深，范围过大，造成手术切开不充分，术后深部创面的炎性组织、物质不能得到充分的引流，第二点就是经过手术以后，排便粪便中的细菌再次感染手术创面，造成二次感染。