据肛瘘内口位置的高低分为低位肛瘘与高位肛瘘，根据肛瘘内口的多少又分为单纯性的肛瘘和复杂性肛瘘，一般对于低位单纯性肛瘘通常可以采用一次性的切除，对于高位肛瘘或者是高位复杂性肛瘘，通常采用肛瘘挂线治疗。
出现肛瘘要及时治疗。药物治疗是很重要的方面，比如使用洗剂坐浴或者外涂药膏进行治疗。另外可以使用中药治疗，内服之后会起到较好的疗效。除此之外手术治疗也是重要的方面，比如对于肛瘘发作期合并感染的病人可以切开引流治疗。
肛瘘的治疗主要是进行手术，保守治疗不能成功，可根据肛瘘具体情况选择挂线疗法、瘘管切开术、肛瘘切除术，从资料来看可能是瘘管切开术，具体情况可咨询手术医生，术后定期换药，去除脓性分泌物，如有必要可应用抗生素药物治疗，忌酒辛辣食物。
治肛瘘治疗费用大约在5000-1万元左右。肛瘘是临床肛肠科常见的一种疾病，大多是由肛周脓肿治疗不及时或不彻底逐渐迁延而来的，导致直肠出现瘘道不经肛门与外界相通，而出现漏粪汁的现象，发生炎症感染时都会出现疼痛，出血的症状。
肛瘘是肛周脓毒症的频谱的一部分。它是一种缓慢疾病，也许会呈现从头或急性肛门直肠周围脓肿后。肛瘘致使的各种长时间或间歇性表现，包含疼痛，分泌物。管理的方针是铲除瘘管，避免复发，一起坚持控制。