肛瘘一般自己不会好，要进行手术治疗。急性炎症期或慢性复杂性肛瘘，可伴有全身症状，如发热、贫血、消瘦和食欲不振等。肛瘘的治疗以手术为主。肛瘘一旦形成就没有自愈可能，具体多长时间好主要还与肛瘘轻重有关。
肛门感染：肛瘘是会出现感染和发炎，在出现肛门疼痛和肛门感染，流出的脓水不仅是会污染内衣的，同时脓液也是会刺激肛门的皮肤，这是肛门就会出现剧烈的瘙痒，长此以往是会导致身体出现消瘦，精神不振和抵抗力降低。
蒜头是不可以治疗肛瘘的，对肛瘘的病人来说，是不会有什么有利的作用的，只会加重病人的病情的，会导致病人出现大便干燥的症状的，病人是不可以吃一些辛辣的东西的，其中也包括大蒜，还有一些调味品。
肛瘘挂线治疗一般是根据病患的病情做的，还是比较好的手术方法，一般橡皮筋都是自行推进的，不用担心，一般半年内脱落，肛瘘的治疗需要对个人进行对症治疗。对于肛瘘手术，可以进行简单的肛瘘。肛瘘拔丝手术一般是比较复杂的肛瘘。吊索脱落通常需要两周左右，吊索完全恢复需要一个月左右。
效果好，如果有些高位肛瘘只能通过手术治疗，主要目的是保护肛门括约肌的功能，或者注意术后及时换药。应注意保持创面清洁，饮食中多吃新鲜蔬菜和水果，养成定时排便的习惯，避免坐太久，尽量少吃辛辣刺激的食物，防止肛瘘复发。