肛瘘要及时就医，还要注意肛门护理，坐姿时要让肛门悬空透气，便后要用水清洗干净，熏蒸坐浴要保证足够时间，大便后不但要用肛部清洁器冲洗，还需要用肛部消毒巾擦拭消毒，因为便血的伤口会受到大便中细菌的污染，如果不及时消毒，细菌滋生会造成病情恶化。
安氏疗法。采用探针检查和双氧水灌注的方式，准确检查内口，这种科学的检查方式准确率高达99%，为下一步治疗提供依据。接着，对病灶部位进行治疗。对肛瘘的治疗采用微创的小切口，对主要的病灶部位切开，对口引流，对内口和外口分解处理，部分切开部分保留，化复杂为单纯。
肛瘘的一部分原因，是因为人体内湿热，保持健康饮食习惯。不要吃油腻和湿气重的食品。饮食以清淡为主要，多吃绿色的蔬菜，多吃富含蛋白质的食物。去医院肛肠科进行检查，确诊后进行手术治疗。
肛瘘的治疗方法目前普遍采取手术治疗，手术是肛瘘的唯一方法，肛瘘分为单纯性和复杂性，低位和高位，手术方式也不一样，如果是高位肛瘘需要采取挂线治疗，一次性切除容易损伤肛管直肠环而引起肛门失禁等。
根据瘘管深浅、曲直，可选用挂线疗法、肛瘘切开或切除术。手术治疗，原则是将瘘管全部切开，必要时将瘘管周围瘢痕组织同时切除，使伤口自基底向上逐渐愈合。电疗仪治疗，运用现代肛瘘电疗仪的高温物理技术治疗，利用电弧放电产生高温，对局部组织进行烧灼，以切开肛瘘达到治疗目的。