治慢性结肠炎的方法有一般治疗、药物治疗等。
慢性结肠炎是一种慢性、反复性、多发性、因各种致病原因导致肠道的炎性水肿，溃疡、出血病变。日常生活中要注意不能食用辛辣、刺激性的食品，也要避免食用生冷的食物，还要避免着凉。必要时患者可以遵医嘱使用结肠炎丸进行治疗。如果症状比较严重，建议患者及时前往医院就诊，日常多吃蔬果。
属于一个清热解毒药，具有治疗肠炎的作用，治疗的肠炎，绝大多数应该属于这种细菌性肠炎，对于其他例行的肠炎，比如真菌、阿米巴一些肠炎的效果可能就比较差，因此对于有肠炎的人想要进行治疗的时候，选择它还是可以的，但是因为这个病情的疗效可能有差异。
治疗直肠炎，首先要注意脂肪和膳食纤维低的食物。因为患有直肠炎往往伴有脂肪吸收不良现象，严重者伴有脂肪泻。吃含脂肪太多的食物，除不易消化外，其滑肠作用常会使腹泻症状加重。请到医院做详细检查，在医生的指导下悉心治疗，早日康复。
根据引发直肠炎的病因及疾病表现采取相应的治疗措施。对症给予灌肠、外用药。加强锻炼，增强自身抵抗力。换季时及时增减衣服以防感冒。放松心情，注意饮食卫生。忌烟酒，防寒凉。
直肠炎初期治疗主要是包括几个方面。首先生活饮食调理，进食少渣、清淡、营养丰富无刺激的食物，保持心情愉悦。其次积极对症治疗，症状明显的病人可以局部用药，可以选择痔疮类的栓剂，当有大便嵌顿者保留灌肠，急症、重症者选用免疫抑制剂或是激素类药物。
克罗恩肠炎一般可以进行药物治疗。
对于无合并症的克罗恩病患者，其治疗的方针是：全面的支持疗法和减轻相关的临床表现，在运动期间要卧床，给予高营养、低渣食物、停止进食、改善电解质、电解液、静脉高营养支持、贫血，需要服用维生素，b12，叶酸，铁元素，以及低蛋白血症，可以通过注射蛋白质或血浆来抑制肠道炎症，比如甲硝唑，水杨酸柳氮磺吡酯等。一旦有什么并发症，比如肠道阻塞，肠穿孔，甚至是脓疡，都需要做外科治疗。
