肛周脓肿起病急，症状明显，痛苦大，要想治疗肛周脓肿，只能通过手术的方法进行治疗。手术治疗主要采用抽脓减压、切开排脓的治疗方法，根据不同位置的肛周脓肿，采用不同的手术方式：低位脓肿－直接切开；马蹄脓肿－切开加旷置；高位脓肿－挂线术；高位脓肿-等压引流术，药物治疗：可以口服抗生素、使用外用药物或者内用药物进行治疗，主要起辅助作用。
肛周脓肿保守治疗是以抗生素治疗为主，可以口服抗生素，如果消炎药物治疗效果不好，有的需要手术切开引流，后期形成肛瘘后行二次手术，平时饮食清淡，少吃辛辣食物以及烟酒。避免就蹲久坐久站，保持大便通畅，排便后清洗肛门，相关药物坐浴，定点定时排便。
便血、疼痛、突起和脱出、肛门潮湿和瘙痒、大便困难都是肛周脓肿的症状。每天坐的时间不要太长，要每隔一个小时运动几分钟。零食都不要吃，吃零食会便秘。如果有时间，必须坚持每天散步达到三十分钟以上。坚持每天清洗保持卫生。每天进行二十到四十分钟的肛门按摩。注意饮食，忌食辛辣刺激食物。把坐椅换成硬板椅，不用软坐椅。多吃根颈类食物。
情况和提供症状初步属于肛周湿疹，每次大小便后清洗外阴和肛周，同时每晚温水坐浴，穿纯棉内裤，开水烫后太阳晒干每天勤换，不缓解肛肠科医生面诊检查排除，不要盲目诊断。
肛周脓肿中药治疗方法脓肿没有形成的早期阶段，可以应用汤药进行对症处置，药物可以祛除体内的火邪，阻止脓肿进一步形成。脓肿已经形成，应用中药主要是外敷外用的方式，使脓尽快排出来，这样对于人体的影响会降到最低，对于疾病的预后也有好处。
该肛周脓肿主要由肠道细菌进入肛窦并扩散至肛周间隙引起的肛腺感染引起。一旦肛周脓肿形成，服药不能减轻肿胀，但需要手术治疗。一旦形成，应在医生的指导下及时进行手术，并积极进行抗感染治疗。平时，要注意肛周卫生，避免便秘，不要坐太久，养成良好的排便习惯。