肝脓肿多为真菌或细菌感染所致，此外溶组织中阿米巴原虫可能存在，存在危及生命的危险，必须及时治疗，可因腹腔内有感染累及肝脏所致，可做些CT检查及B超检查确诊，再经抗生素治疗及手术切开引流完全痊愈。
肝脓肿除了需要针对病症治疗外，因为肝脏功能可能会受到影响，所以还可以采取部分保肝治疗。治疗期间戒烟戒酒，饮食清淡。
肝脓肿是一种感染性疾病，主要是由于感染了细菌或阿米巴原虫而引起的局部组织溃烂和化脓。
其中以细菌性肝脓肿最为常见，约80%的肝脓肿为细菌性肝脓肿。阿米巴肝脓肿是一种由肠道阿米巴感染引起的肝脓肿，需要积极治疗，同时还需要规范的抗生素抗感染治疗。治疗分为内科治疗、经皮肝穿刺、外科手术等。肝脓肿患者症状重，有全身感染情况时需加强全身治疗，加强营养，必要时可输入白蛋白。患者应遵医嘱足量、足疗程应用抗菌药物，还要注意观察药物的不良反应。
肝脓肿在脓腔消失后，症状消失，炎症完全控制后就可以达到治好了。防止本病的关键是注意饮食卫生，预防病从口入，在传染源头上下功夫，切断传染源，将被传染的可能性降到最低。衣着适量，床褥勿盖过多，及时更换汗湿的衣裤和床单，以保持清洁和舒适。
治疗肝脓肿的药物是碳青毒烧类、第二代头抱菌素、氨基首类等药物。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。常用的药物有碳青毒烧类、第二代头抱菌素、氨基首类、甲硝唑、替硝唑等。
建议患者在用药期间注意饮食清淡，避免吃辛辣、油腻的食物。
糖尿病性肝脓肿主要可表现为发热、肝区疼痛等症状。
糖尿病患者容易出现肝脓肿，因为血糖控制不好容易导致细菌滋生。以肝脓肿为例，由于感染，糖尿病患者可出现发热，也可表现为高热。用退烧药治疗后，短时间内体温会正常，之后又会回升。发烧前往往会出现畏寒怕冷的症状。由于肝脏脓肿的存在，糖尿病患者还会有右上腹部胀痛的感觉。糖尿病患者要控制好血糖。
肝脓肿消瘦是属于正常的，肝脓肿的症状就是出现消瘦，尿红，黄疸，贫血的现象，后期多畏寒多汗，治疗方式是进行手术切开脓肿引流，肝脓肿是由于细菌感染导致的，而常见的细菌有金黄色葡萄球菌、大肠埃细菌以及厌氧菌等导致的。