治疗输卵管积水可以进行促排卵治疗包括诱发排卵和超排卵治疗，诱发排卵应用于女方排卵障碍，一般以诱发单卵泡或少数卵泡发育为目的。也可以进行输卵管因素的治疗，对输卵管通而不畅的，可用输卵管通液术进行治疗。
输卵管积水可以到正规医院手术治疗。术后保护好自身状况，不要受凉风，凉水。增加营养，饮食清淡，不吃辛辣。多卧床休息，不做重活，心情要积极乐观，不要压抑。遵医嘱用药，定期去医院复查。
没有症状的输卵管积水不需要特殊处理的。因为积水输卵管会丧失运输卵子的功能，还可能会对子宫内膜产生毒性作用。所以如果还有生育要求。切除积水输卵管，另一侧输卵管如果通畅，可以试着自然怀孕。如果两侧输卵管均积水。还需要加用一些微波或者短波等物理治疗，治疗十天到半个月之后需要去医院复查。
结核性炎症是一种特殊性炎，也可以引起输卵管积水.结核最常侵袭的是肺部，引起咳嗽，咳痰，咯血等局部症状以及长期低热，易倦，乏力，食欲不振和体重减轻等全身症状.当结核杆菌进入血液后血行播散到达腹腔，可以引起腹膜，小肠，盆腔，子宫，输卵管，膀胱的炎症.结核性炎症引起输卵管伞端粘连梗阻，破坏伞端的功能造成不孕。
治疗输卵管积水中医主要是活血化瘀通络、祛湿排毒、补气血、健脾胃、培土生金、固本清源等，来消除炎症，来缓慢清楚积水。在这期间要多喝水，多吃新鲜的蔬菜和水，不要吃上火的食物。
以给予下腹部红外线理疗配合消炎药治疗，以控制症状为主，没有症状的输卵管积水不需要特殊处理的。因为积水输卵管会丧失运输卵子的功能，还可能会对子宫内膜产生毒性作用。如果还有生育要求，切除积水输卵管。