少精症可以通过激素治疗或者是替代的激素治疗这种方式，比如用促卵泡生成激素、促黄体生成激素这种药物来进行治疗少精子症，尤其是严重的少精子症或者是无精症。
治疗少精症目前有效方法是“强精活化疗法”强精活化治疗是依据组织胚胎学、生物物理学、组织细胞学、细胞免疫学的原理，在祛除病因的基础上，采用中西医结合个性化治疗，通过循证医学证据证明达到满意疗效。
少精症跟男性炎症、熬夜、疲劳过少，还有男性不良嗜好，生精细胞功能异常等，都可造成男性少精症。可以适当补充锌元素，可以维持个助长男性性机能、提高精子数量，提高精子各方面的质量。
少精症的治疗，原则上是查明病因，对症处理。对于内分泌紊乱引起的少精症，要根据内分泌激素检测结果给药；对于生殖道或附属性腺的急慢性感染，要给予抗生素抗感染治疗；对于抗精子抗体阳性的免疫性因素，则要使用免疫抑制剂；对于精索静脉曲张、大量鞘膜积液者，要尽早手术治疗；对于营养缺乏者，则给予适量的微量元素、精氨酸、维生素的补充治疗。对于严重少精症，可采取夫精授精或试管婴儿技术助孕。
少精症主要是病因治疗：性腺激素功能正常或低促性腺患者，进行内分泌的治疗及抗氧化的治疗。不能通过内分泌治疗的患者，可考虑通过人工授精或试管的方法助孕；精索静脉曲张导致的少精子症，通过评估病人的生精内分泌轴、精液状况、睾丸体积等，提供患者较恰当的治疗方案。