因病情程度不同，个体差异等，治疗时间也不一定。早期发现和早期治疗是治疗排卵障碍的关键，多采用中西医三期疗法：根据月经特殊生理现象，根据各阶段的变化，将药物分阶段用于中医与西医相结合，以中医药治疗为主线，个性化的特定治疗。
排卵障碍经一定要治疗，一个月可以看到效果，对于排卵障碍的治疗方法主要是诱发排卵，有药物、手术等治疗方法。手术治疗主要用于药物治疗无效的多囊卵巢综合症、甲亢、肾上腺皮质功能亢进、肿瘤性疾病等。
排卵障碍的治疗是通过诱发排卵，药物，手术等治疗方法。中西结合三期治疗，根据月经特殊生理现象，根据各阶段的变化，将药物分阶段用于中医与西医相结合，以中医药治疗为主线，个性化的特定治疗。
排卵障碍可以做个造影检查，一般在月经干净后3-7天就可以去医院做造影检查了，造影前三天不可以同房，防止感染，如果输卵管造影检查发现堵塞，需要通水治疗，如果没有堵塞，那么最近三个月同房也要做好避孕，主要是因为造影需要接受大量的X线照射，过早怀孕容易导致胎儿发育缺陷，造成自然流产的现象。
导致女性出现排卵障碍的问题有内分泌紊乱，卵巢局部因素等，排卵障碍一般可以采用促排卵药物进行治疗，也可以配合中药进行调理，由于每个人的身体体质都是不同的，所以治疗的时间长的也会因为个人情况而不同。
1-2年，造成排卵障碍的因素有：中枢神经系统性无排卵；下丘脑性无排卵；垂体性无排卵；卵巢性无排卵；多囊卵巢综合征；卵泡黄素化不破裂综合征；其它：性腺以外的其它内分泌系统如甲状腺、肾上腺皮质功能失调和一些全身性疾病。