排卵障碍治疗应该按照其发病原因开始入手，通常最主要讲述的是最常见的一种由于内分泌失调而导致的排卵障碍，排卵障碍也可以称之为不排卵是女性不孕临床上非常常见的原因，排卵与下丘脑、垂体以及卵巢功能有一定关系，排卵障碍不孕病患应该及时检查治疗，因此，排卵障碍的治疗主要是针对病因采取有效的治疗措施。
治疗女性排卵障碍，可以内分泌紊乱入手，对有合并有内分泌紊乱疾病的病人，还要接受内分泌紊乱的治疗，在内分泌状态相对良好的时期怀孕，可以减少流产率及孕期并发症的发生。或者加强黄体功能，部分排卵异常是由黄体功能不足所致的，也需要加强黄体功能。
治疗的目的主要是建立有排卵的正常月经周期，恢复生育能力，消除多毛。一旦建立了正常的月经周期，就能受孕，卵巢也不再产生过多雄激素，多毛也随之消失。恢复正常月经周期。
排卵障碍初期应内分泌检查，检测有没有排卵或者是黄体功能不全。查明病因。如有排卵，了解B超卵泡监测，采用B超对卵泡进行监测。如无排卵应行原发病治疗，再行促排卵治疗。
一定要及时到正规的医院接受治疗，遵从医生的嘱咐，避免错过治疗时机，卵泡发育到1.8-2.5cm属于正常范围。如果不排卵属于排卵障碍造成排卵障碍的因素有：中枢神经系统性无排卵；下丘脑性无排卵；垂体性无排卵；卵巢性无排卵；多囊卵巢综合征；卵泡黄素化不破裂综合征；其它：性腺以外的其它内分泌系统如甲状腺肾上腺皮质功能失调和一些全身性疾病如重度营养不良可影响卵巢功能的调节而导致排卵障碍。
中医师认为排卵障碍也是由于肾虚所致，可兼气虚、血热、肝郁、血虚或痰阻所致。中药促排卵药物需从补肾健脾、益气生血、疏肝解郁、化痰通络着手，从整体上调理女性生理功能从而达到促排卵的作用，平时要注意饮食，积极锻炼身体。