排卵障碍治疗应该按照其发病原因开始入手，通常最主要讲述的是最常见的一种由于内分泌失调而导致的排卵障碍，排卵障碍也可以称之为不排卵是女性不孕临床上非常常见的原因，排卵与下丘脑、垂体以及卵巢功能有一定关系，排卵障碍不孕病患应该及时检查治疗，因此，排卵障碍的治疗主要是针对病因采取有效的治疗措施。
先利用西医药疗效快、针对性较强的优势，作为先导治疗，有效控制病情发展，减轻不适，同时可以为下一步中医药治疗打好生理基础；然后在恰当的时机，再通过中医中药方法综合调理内分泌平衡。
针对卵泡的月经期、卵泡期、排卵期、黄体期四期，给予中药辩证施治，治疗疾病和改善体质的同时，促进卵泡发育排出，并维持排卵后的黄体功能。可给予适度卵巢“卵泡穿刺技术”促使卵子排出。
排卵障碍根据病因不同，治疗也不一样。导致排卵障碍的常见病因是多囊卵巢，卵巢早衰，内分泌失调等情况。一般是需要针对性的调理，比如通过建立人工周期的方式恢复自然排卵，或是采用促排卵药物治疗。
中医师认为排卵障碍也是由于肾虚所致，可兼气虚、血热、肝郁、血虚或痰阻所致。中药促排卵药物从补肾健脾、益气生血、疏肝解郁、化痰通络着手，从整体上调理女性生理功能从而达到促排卵的作用，排卵有障碍的病患可用中药治疗。