一般情况下，男性功能性障碍可以采用以下方式进行治疗：
肾虚所致的男性功能性障碍，可以遵医嘱口服男宝胶囊、金锁固精丸等药物进行治疗。患者平时要多做运动，避免纵欲，可以多食用生蚝、板栗等补肾固精的食品。如果是早泄，最好是避免自慰，如果病情比较严重，可以考虑进行外科手术。还可以考虑是由于前列腺炎、尿道炎、精囊炎等导致的男性功能性障碍。
性勃起功能障碍经常是由肾气不足引起的，就是配合，吃点中药来调理一下，可以去当地看看中医。服用中药来调理，平时一定要调理好，尽量避免过度疲劳，并以清淡的饮食为主。
一般情况下，严重功能性消化不良，可以通过心情疏导和调节气机来治疗。具体分析如下：
平时多听音乐，多参加一些室外运动，避免紧张焦虑、烦闷抑郁的心情，有助于改善消化不良的症状。还可以通过口服莫沙必利、莫沙必利等在医师的建议下进行缓解。此外，精神萎靡、消化不良等精神障碍的人，还可以口服三环类的抗抑郁药物，用于精神状态比较突出的功能性消化不良。
甲减出现后，终生口服甲状腺激素制剂治疗。主要有干甲状腺片、左甲状腺片两种。
干甲状腺片是动物干制剂，由于其中甲状腺激素含量不稳定且T3含量过高，目前普遍采用的是左甲状腺片，而不是干甲状腺片。一般早晨空腹口服，少量定期复查甲功，根据甲状腺激素水平逐渐调整剂量，直到血液中甲状腺激素和促甲状腺激素调整到正常范围内。正规治疗后，患者一般预后较好，可长期生存，不影响甲减患者的工作、生活和生育，但维持治疗期限须每半年复查甲状腺功能。
可以通过性感集中疗法进行治疗，其主要是要求男性在性生活时充分享受性刺激，克服心理障碍，从而来改善阳痿的症状。功能性阳痿主要是由于心理原因造成的，常见于男性心理焦虑，紧张等原因。
