肝内胆管结石的治疗根据病情的轻重程度及治疗是不一样的。如果经过CT或磁共振评估，肝内胆管结石很少，或者根本没有引起胆道扩张，狭窄畸形，肝脏也无改变，也没有临床症状，那么这种结石可以不用特殊治疗，只需要平时注意避免劳累受凉，少吃油腻食物，必要时可以服用利胆药物即可。而对于有经常发作胆管炎或导致胆管狭窄畸形，或是引起肝脏萎缩，癌变等等情况等，需要进一步手术治疗。
肝内胆管细胞癌是原发性肝癌中的一种。原发性肝癌包括肝细胞癌，大约占百分之85到90。还有就是肝内胆管细胞癌，只占到了百分之10左右的比例。还有肝细胞癌和肝内胆管细胞癌相混合的，这种称之为混合型。
肝内胆管多发结石是因为胆囊炎反复出现导致的，可以吃点口服利胆药，要定期进行复查，时候要是结石继续变大，时候就要进行手术治疗，现在还是要继续进行药物治疗，要多吃新鲜的水果和蔬菜，保持良好心情。
多发性肝内胆管结石指肝内胆管多发结石。肝内胆管结石是指发生于左右肝管汇合部以上的结石，肝内胆管结石的病因复杂，主要与肝内感染、胆汁淤积、胆道蛔虫等因素有关。
肝内胆管位于人体的肝脏内，通常肝内胆管有粗细之分。一般肝内胆管起自于毛细胆管，也就是比较细的胆管，会合成小叶间胆管，然后再逐步的汇合呈肝段、肝叶的胆管以及肝内部分的左右肝管。
肝内胆管错构瘤是生长发育期形成的伴随肝门结构生长的肿瘤，而不是新生肿瘤，一些病理学家认为很不排除是原始间叶细胞异常的发育，这种异常发育很可能发生在胚胎晚期，当肝形成小叶结构与胆管连接时，更多的理论假设这些病灶实际比单纯生长更活跃。