主要为腹泻及软便，偶有皮疹、恶心，停药后消失。偶见过敏反应。本品适用于对本品敏感的致病菌所引起的呼吸道感染，下尿路感染，如膀胱炎、尿道炎和肠道感染以及皮肤软组织感染。
最多的服用时间是3天。如果3天症状仍无缓解。就应该考虑换药。否则就会增加副作用的。为了充分发挥药物的有利作用，尽量减少或避免不良反应，还必须研究影响药效的各种因素，选择最佳的用药方案，制定切合实用的药物联用组合等。
磷霉素钠对于大部分革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌都有一定的杀菌疗效。药物可用于敏感菌所导致的呼吸系统的感染、皮肤感染、泌尿感染、肠道的感染等，可以联合使用，治疗敏感菌所导致的重症感染。
这种药是可以治尿路感染的。在体外对一些常见的引起尿路感染的需氧菌具有广谱抗菌活性，这种药对包括尿肠球菌、枸橼酸杆菌、弗氏枸橼酸菌、产气肠杆菌、克雷白杆菌、肺炎杆菌、奇异变形杆菌、普通变形杆菌、粘质沙雷氏菌等在内的90%菌珠，最低抑菌浓度(MIC)为64μg/ml或更低。
磷霉素和头孢无法比较。头孢类药物有很多，可分为第一代、第二代、第三代、第四代。磷霉素在临床上一般不单独使用。经研究发现，磷霉素有破壁的作用，一般与其他抗菌药物联合应用，增强抗感染的作用。抗菌药物没有好和坏之分，适用才是合适的。
婴儿可以注射磷霉素钠。磷霉素钠，用于敏感菌所致的呼吸道感染、尿路感染、皮肤软组织感染等。也可与其他抗生素联合应用治疗由敏感菌所致重症感染如败血症、腹膜炎、骨髓炎等。
