治疗亚临床甲减没有什么特效的疗法。不要盲目用药，治疗的药物有多种，但都有一定的适应症，不一定都适合每个人，用药不对症，产生了抗药性、耐药性，致使延误病情，错失最佳的治疗时机。
如何处理甲减和亚临床，应根据病人具体情况决定。
如亚临床甲减患者，通常无症状，也无体征，常因查体后被人发现，因此，绝大部分亚临床甲减无需处理。对于甲减症患者来说，可以选择药物进行辅助治疗，比如使用左甲腺素钠或者右甲素，这都能够取得较好疗效。但若伴有较严重的甲减症状如乏力、便秘等，且Tsh大于10毫国际单位每升，病人再次合并动脉硬化，血脂异常和甲状腺相关抗体升高的问题，需要处理。因此，亚临床甲减和甲减都应该进行治疗，而不能简单地把二者对立起来。
亚临床甲减是没有明显的临床症状，例如典型的甲低表现，眼睛肿、皮肤干燥、大便干燥、记忆力差，但是可能会有生化检查的异常。例如血脂高、TSH高，而没有特别明显的临床上的表现，即亚临床甲减。所有临床上只要前面加一个亚字，就是临床症状不典型。
孕妇甲减要注重补充膳食钙，预防胎儿缺钙和母体骨质疏松。但钙有妨碍碘在消化道的重吸收，所以两者食用时应相隔一定时间。平衡膳食，荤素搭配，粗细配比，尽量使食物品种多样化，注重营养的同时，可预防大便干燥。以高热量且易消化食物为主，适当补充碘，可食用含碘丰富的食物，也可食用一些碘强化食品，慎用富含高胆固醇和肥甘滋腻之品的食物，如奶油、动物脑及内脏、花生米、杏仁、肥肉、甘乳酪等。
一般情况下，亚临床甲减能否自愈需根据实际情况来判断，具体内容如下：
亚临床甲减会不会自行痊愈取决于具体的原因。如果是由于甲亢服用过多而引起的亚甲减，一般在三到四个星期内就会痊愈。如果是由于自身免疫所引起的亚甲基化，例如桥本甲状腺炎所引起的亚甲基化，其自身恢复能力极低。当体内的抗体增加时，对机体的损害就会增加，从而导致病情恶化，如果有了临床上的甲减，则要终生口服左甲状腺素片。
一般来说，亚临床甲减可以怀孕，具体分析如下：
临床甲减，如果病情得到了良好的治疗，治愈后是可以怀孕，但是如果病情没有稳定，尽量不要怀孕，可能会对孩子的智力发育会有一定的影响的。
应该注意休息，早睡早起，不要进行重体力劳动，避免剧烈运动，同时保持愉悦的心情，以清淡、易消化的饮食为主，保持良好的饮食习惯和睡眠习惯，少吃零食、速食，有利于身体的恢复。
