治疗传染性软疣的方法有物理治疗、药物治疗等。
是用刮刀或钳子将小瘤小体刮掉，在处理过程中要特别小心，要一次彻底的清理干净，避免感染。还可以使用带有腐蚀性的药剂进行局部涂抹，使蛋白凝固坏死脱落，虽然疼痛程度要比用钳子刮伤要轻得多，但局部还是会感觉到灼热和疼痛。平时要避免使用搔抓、挤压等方式来进行皮肤的损伤，避免接触高油脂的地方。
治疗传染性软疣的方法是药物和手术。
传染性软疣是感染传染性软疣病毒所致，可以通过直接或者间接接触、性接触等途径传播。患者可以在医生的指导下使用鬼臼毒素软膏、咪喹莫特乳膏等抗病毒药物治疗，还可以进行刮除术，将局部皮损清除。
建议患者在治疗期间性生活，戒烟限酒，定期复查。
通常没有治疗传染性软疣最好的方法这一说法。传染性软疣患者通常可以通过使用药物、日常护理等进行治疗。
1.使用药物：传染性软疣患者的身体一般会出现疣体，还可能会伴随出现刺痒的情况。患者可以使用氟尿嘧啶溶液、硼酸软膏等药物进行治疗，可以改善症状。
2.日常护理：患者应注意休息，避免抓挠皮损，避免和人共用私人物品。
传染性软疣可以通过药物、物理治疗等方式进行治疗，不存在最好的方法。
传染性软疣属于一种皮肤病，对于传染性软疣，可以选择适当的外用药物，并且也可以通过物理治疗，冷冻疗法是比较常见的物理治疗方式，还可以通过微波疗法来治疗。但药物请严格按照医生的指示，不要自行使用。
传染性软疣是病毒感染引起的，需要积极尽早治疗，否则可能会逐渐增多。去当地皮肤科进行激光治疗或者冷冻治疗，也可以在消毒后直接钳夹。部分患者可能会复发，为了预防复发，可以同时口服免疫调节剂。
传染性软疣是可根治的。
传染性软疣的治疗方法有手术，激光，冷冻，电灼等、药物和其他途径可根治，提示患者应根据实际情况选择特定治疗方案。部分患者甚至可以自愈，通常在半年至九个月后可自行消退，还有坚持3~4年的。它是由自身抗体的生成来决定的，和自身抗体出现的迟早，抗体生成越早，皮损消退越早。