病毒疣具体的治疗方式也各不相同，所以也不能确定哪一种是最好的。
目前疣的治疗方法有冷冻、电灼、激光、外用药物等。其目的是破坏疣体，调节局部皮肤生长，刺激局部或全身的免疫应答。
治疗要考虑疣的类型、年龄、治疗史和治疗效果，任何一种治疗都要在2~3个月内进行。注意并不是全部疣都要治疗，有些疣如果不经过处理就会自动消退。
病毒疣一般指疣，一般是通过外用药物和物理疗法来进行治疗。
外用药一般是针对大面积的皮疹或者是难以进行物理治疗的，具体的用药和方法也会有所不同。维A酸软膏主要用于治疗扁平疣，对顽固性跖疣，平阳霉素、5-氟尿嘧啶注射液均能引起疣体萎缩、脱落。对于皮疹数量较小的患者，一般采用冷冻、电灼、刮除、激光等物理治疗。
病毒疣一般指疣，使用药物治疗、微波治疗等效果较好。
疣的治疗效果较好，经过积极的治疗，有根治的可能，临床常用的药物有氟尿嘧啶软膏、水杨酸、斑蝥素、平阳霉素等，患者也可以采用微波治疗，使机体组织在很小的范围内瞬间产生高温，从而使其发生坏死，起到治疗效果。
病毒疣这个一般会感染人类的皮肤和表层黏膜。有高度的特异性，生长在生殖器官附近皮肤和黏膜上的人类寻常疣、尖锐湿疣以及生长在黏膜上的乳头状瘤。病毒疣一般只能对症治疗，激光冷冻治疗即可，主要是要提高免疫力，因为这个是病毒感染，只有靠免疫力将病毒打败才是最根本的方法。
病毒疣是属于一种病毒感染，长相很像鸡眼和疙瘩状，粗粗的硬块，所以常被患者误以为鸡眼而延误治疗，是一颗颗地角化硬块，肉眼下可见一些黑色的小点位于此硬块中，这些小黑点都是皮内出血点。由此点可以跟鸡眼做一个分辨。