一般“人乳头瘤病毒什么药治最好”的说法不合理，患者可以在医生的指导下使用药物进行治疗。
人乳头瘤病毒可以通过外用药来进行局部用药，例如五氟尿嘧啶软膏，以及口服干扰素等全身免疫调节剂。人类表皮细胞是HPV感染的唯一的寄生因子，它可以透过受损的皮肤侵入到表皮，并在表皮上繁殖，造成表皮上皮细胞增生，从而造成疣样病变。同时也可以进行激光、冷冻等局部外科治疗，或者是外敷药物。
人乳头瘤病毒一般指人乳头瘤病毒感染。人乳头瘤病毒感染是否好治，需要根据实际情况进行判断。
人乳头瘤病毒感染有高危型与低危型之分，低危型感染多发生在皮肤，如尖锐湿疣，寻常疣，较易处理。如果是高危型感染，如果是一过性的感染，一般不需要治疗。如果发展成了宫颈癌，通常比较难治。
因此患者应该尽早治疗。
干扰素、胸腺五肽、转移因子等都是目前治疗人乳头瘤病毒的主要药物。
人乳头瘤病毒可以引起细胞免疫，使其产生更多的细胞因子，从而将人体中的HPV清除。人乳头瘤病毒能感染皮肤，导致多种疣样皮肤病。人乳头瘤病毒的主要宿主是人类表皮细胞，可以透过皮肤的损伤，进入表皮，在表皮细胞中繁殖。
人乳头瘤病毒感染可按医生的要求及时用干扰素治疗，亦可服胸腺肽、转移因子之类的药治疗。
对于患者来说，需要选择合适的方法进行预防和治疗，比如外用干扰素，口服胸腺肽、转移因子。此外，也可通过物理等方法加以改进，比如激光或冷冻。如情况严重或者出现并发症，亦可采用手术切除。
治疗过程中，要重视补充人体需要的养分补充，忌刺激性食物。
男性人乳头瘤病毒可以使用药物进行治疗。
如果是男性感染了人乳头瘤病毒，可以选择氟尿嘧啶，维A酸等药物进行治疗，虽然没有手术治疗那么快，但是药物治疗没有手术切除那么麻烦，而且对人体的伤害也不大，所以很多人都会选择用这种方法。必要时患者可以去医院进行手术治疗。
男性人乳头瘤病毒感染可以通过观察法、外用药物、物理治疗、手术治疗等方法来治疗。
1.观察法：男性感染人乳头瘤病毒后，如果没有皮肤黏膜的损伤，没有任何不适症状，可以通过锻炼和观察来自行恢复。
2.外用药物：如果人乳头瘤病毒感染引起尖锐湿疣，可外用足叶草酯、足叶草莓素、1%酞丁胺酸等药物进行治疗。
3.物理治疗：可采用高温激光烧灼或低温液化氮冷冻等方法去除疣体。
4.手术治疗：如果疣体较大，病毒疣也可通过手术切除。
男性HPV感染后要及时就医，在医生的指导下进行治疗。