传染性软疣的诊断方法是进行病毒的细菌培养和病毒的DNA分析，可以用表传染性软疣的感染性病毒粒子和抗原检测方法来判断。
电子显微镜下，组织切片，阳性。
组织学检查：临床表现为感染性的软疣。
感染性的软疣，可以通过挤压干酪样物质，瑞特染色的软疣小体（+）进行检测。
传染性软疣可以进行体格检查项目和血常规检查。
可用视诊与触诊相结合的方法观察是否有丘疹及丘疹的形态，色泽，质地，根据丘疹的大小与表面的光滑程度，质地与活动度来判断其是否属于传染性软疣。根据外周血象中白细胞，血沉，C反应蛋白的增高与否来判断病人有无严重的感染。
传染性软疣通常建议可以做涂片染色、电镜观察、组织病理学等检查。
如皮肤上出现多个丘疹，表面有蜡样光泽，中央有脐状凹陷，内含乳白色干酪样物质并易挤出等情况，建议去正规医院的皮肤性病科进行检查，确诊后在医生指导下根据患者不同情况进行对应治疗。
日常避免去公共泳池、浴室，不要搔抓皮肤，直至皮损消退。
传染性软疣做以下检查：
1.体格检查：医生会用肉眼观察皮损的分布范围、数量、大小、颜色等，还会用手触摸以评估其活动度、软硬等。
2.病毒培养：该检查能够分离病毒基因，可以帮助医生分清病毒类型。
3.直接涂片：挤压皮肤损害部位可自凹窝内排出乳酪样物质，涂于载玻片，经过特殊的染色处理，光镜下观察可发现软疣小体。
传染性软疣需要做体格检查、病毒颗粒涂片染色。
据其病损尖端凹入脐窝等处，可挤出乳酷状物，并有发病的位置，年龄等特征，然后做病毒颗粒涂片染色，可以明确判断疾病的类型。患者可以采用手术治疗，将所有的软疣完全剔除掉，经过两到三次的治疗，基本就可以治愈。
女性患上传染性软疣做检查通常不需要抽血。
患上传染性软疣对血液的影响非常小，医院去验血并不能够发现明显的异常，患者的皮肤上会形成一下些的突起的丘疹。医生通常能根据典型皮损特点、皮损组织病理学检查等就可以轻易诊断出来。因此患上传染性软疣的女性一般不需要抽血。