治疗病毒疣，首先应根据病毒疣生长在哪里，疣体有多大，有多大等情况，制订治疗方案。
通常可外用氟尿嘧啶软膏治疗、咪喹莫特膏、干扰素软膏，酞丁胺擦剂治疗，如有需要，也可将疣体刮除，再用碘伏、医用酒精消毒，能够有效的改善病症，在治疗期间要注意多休息，有助于病情恢复。
跖疣的治疗可以通过局部手术来完成，而对于较小的状态可以使用局部激光或微波来去除疣。经过激光或冷冻或微波治疗后，局部皮肤会出现坏死和感染的可能性。要及时用碘伏进行局部消毒，防止感染。
通常病毒疣可以根治。
就寻常疣而言，可以用冰冻、雷射、电离子来进行。出现大范围的皮肤炎症时，可以给予免疫调节剂，例如：干扰素、卡介菌多糖核酸注射液等，还可以服用转移因子胶囊。还有就是传染性软疣，通常只要进行有效的刮疣就可以了，一般可达到较好的治疗效果。
疣多由人类乳头瘤病毒感染引起，可以通过皮肤的微小破损自身接种传染，从而越来越多，是具备传染性的，发现就要尽早治疗。治疗的方法主要有：药物治疗；光动力学疗法，系统或局部外用光敏剂，光照后引起局部细胞死亡，可治疗部分寻常疣、尖锐湿疣；物理疗法，冷冻疗法、电灼疗法、激光治疗、红外凝固治疗适用于数目少的寻常疣和跖疣。个别巨大疣体可行手术切除术。
大多数无症状，有时可有瘙痒、疼痛，性交后出血和阴道分泌物。可采取光动力治疗。恢复快、创伤小、治疗后没有复发的现象。亦可采取手术疗法，对于单发、面积小的湿疣，可手术切除；对巨大尖锐湿疣，需要综合治疗。保持良好的心态。
