治疗方法是用小血管钳夹住疣体后挤出白色内容物，然后压迫止血或者用冷冻疗法或激光疗法去除疣体；平时要注意卫生，勤剪指甲，避免搔抓皮肤，不去公共浴池洗澡或游泳，不与他人共用毛巾、衣物等。
在治疗的时候主要是采用物理治疗，比如局部的刮除或者用液态氮冷冻，人工挤压等。临床上最常用的就是在无菌条件下，用有齿镊或者止血钳将软疣夹破，把里边的软疣小体挤出来，然后外用碘酊消毒预防细菌感染。
传染性软疣并没有最佳治疗方法的说法，需要采用合适的方式进行治疗。
疣体夹除术治疗该病效果较好，用手术夹碎软疣并挤去内容物，患者还可以在医生的指导下使用斑蝥素乳膏、西多福韦软膏等药物进行治疗，对传染性软疣病毒有一定治疗的作用，治疗期间要注意清淡饮食，有利于身体恢复。
传染性软疣是可根治的。
传染性软疣的治疗方法有手术，激光，冷冻，电灼等、药物和其他途径可根治，提示患者应根据实际情况选择特定治疗方案。部分患者甚至可以自愈，通常在半年至九个月后可自行消退，还有坚持3~4年的。它是由自身抗体的生成来决定的，和自身抗体出现的迟早，抗体生成越早，皮损消退越早。
传染性软疣完全消失才算痊愈。
传染性软疣病毒会导致传染性软疣。这种疾病在儿童时期，主要是间接接触，而在成年人中则是因为性接触。性活跃、免疫功能低下的人更容易得这种疾病。如果在平时的护理和治疗中，传染性软疣全部消失，没有再出现，则说明疾病已经完全痊愈。
传染性软疣需要进行以下检查。
体检：主要看有没有丘疹、丘疹的形态、颜色、质地等，根据丘疹的面积、表面光滑程度、质地、活动度等来判定有没有传染性。
血常规：根据病人的外周血象、白细胞、血沉、C反应蛋白等情况来判定是否出现了严重的炎症反应。
疱疹刮片：皮肤上可出现几个小的叶子并向下伸展，压迫到皮肤的纤维，形成一个梨状的囊。从基底起，表皮细胞退化，越往上越严重。